پژوهشکده‌ مهندسی سامانه‌های نیرو و پیشرانش از سال ۱۳۸۶ فعالیت خود را به طور غیر رسمی با تشکیل هسته‌ اولیه و انجام پروژه‌های پژوهشی در دانشکده‌ مهندسی هوافضای دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی آغاز نمود. مراحل ثبت این پژوهشکده در وزارت علوم، تحقیقات و فنآوری جمهوری اسلامی ایران در سال ۱۳۹۰ به انجام رسیده است. مأموریت مصوب پژوهشکده عبارتست از: "مطالعه و تحقیق در زمینه‌ سیستم‌های انرژی و سامانه‌های هوافضایی و تجهیزات مربوط به این سیستم‌ها و طراحی و توسعه‌ دانش فنی و نو‌آوری و ساخت در زمینه‌ سیستم‌ها و زیرسیستم‌های مرتبط" تعریف و اجرای پروژه‌های راهبردی به همراه مدل‌سازی و توسعه‌ دانش فنی طراحی و ساخت سامانه‌­های نیروگاهی، هوایی و فضایی از اهداف این پژوهشکده به شمار می‌روند. این پژوهشکده از سه گروه پژوهشی به صورت زیر تشکیل شده است:
۱- گروه پژوهشی نیرو و پیشرانش
۲- گروه پژوهشی طراحی مهندسی
۳- گروه پژوهشی مهندسی سیستم
در طول مدت فعالیت پژوهشکده، پروژه‌های تحقیقاتی بسیار زیادی در زمینه‌های مختلف علوم مهندسی در پژوهشکده‌ مذکور به انجام رسیده که مهم‌ترین پروژه‌های انجام شده به صورت زیر قابل دسته‌بندی هستند:
-مدلسازی فرآیندهای داخلی و شبیه‌سازی فرآیندهای سیالاتی به روش محاسباتی
-تدوین نرم‌افزارهای مدلسازی و طراحی
-تدوین الگوریتم طراحی ابرسامانه‌­ها
-طراحی سامانه‌­های هوافضایی
-مشاوره در ساخت
-مشاوره در پروژه­‌های مهندسی و نیروگاهی اعم از عیب‌یابی یا بهینه‌سازی
-ترجمه متون هوافضایی و گرد‌آوری منابع کاربردی
​​​​​​​پژوهشکده‌ مهندسی سامانه­‌های نیرو و پیشرانش با زیربنای تقریبی ۱۶۰ مترمربع در ضلع غربی دانشکده‌ مهندسی هوافضا (جنب کارگاه اتومکانیک) واقع شده است.