رئیس دانشکده، بالاترین مقام اجرایی دانشکده است. کلیه امور دانشکده تحت مدیریت ریاست محترم دانشکده و معاونین ایشان انجام می شود. در حال حاضر جناب آقای دکتر «مهرزاد شمس» مسؤولیت ریاست دانشکده مکانیک دانشگاه خواجه نصیرالدین طوسی را بر عهده دارند.